Операция выполняется преимущественно лапароскопическим доступом через несколько проколов 5–10 мм. В брюшную полость подается углекислый газ, после чего вводятся миниатюрная видеокамера и инструменты.
Хирург максимально осторожно отделяет кисту от окружающей ткани яичника, стремясь вылущить ее капсулу целиком и одновременно остановить капиллярное кровотечение. При обнаружении очагов эндометриоза на брюшине и связках они также коагулируются (прижигаются) или иссекаются.
Здоровую часть яичника максимально сохраняют. После удаления кисты не требуется наложения швов — орган восстанавливается естественным образом.
В отдельных случаях, когда доступ лапароскопическими инструментами затруднен из-за выраженного спаечного процесса, может выполняться открытый разрез.